Principal diferença
Marcadores genéticos são genes localizados em uma posição conhecida em um cromossomo que são usados para identificação de indivíduos ou espécies. Um marcador genético é uma sequência curta de DNA que pode ser descrita como uma variação que pode ser observada. Marcadores genéticos são usados para estudar a conexão entre doenças hereditárias e causas genéticas. RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA) e RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) são tipos de marcadores genéticos. Ambos diferem um do outro em muitos aspectos como: a quantidade de DNA necessária em RAPD é menor enquanto em RFLP uma grande quantidade de DNA é necessária para quantificação.
RAPD
A amplificação aleatória de DNA polimórfico ou RAPD é uma técnica útil usada para construir um mapa genético. É um método baseado em PCR em que os segmentos de DNA que são amplificados são aleatórios. É um método muito básico para obter impressões digitais moleculares ou espécies de cepas. RAPD pode detectar 1 a 10 loci. O uso de primers aleatórios ajuda a analisar a diversidade genética de um indivíduo. RAPD requer apenas um único primer para amplificação. RAPD não requer conhecimento particular da sequência de DNA do indivíduo alvo, o que é improvável para outros métodos tradicionais de PCR. RAPD é uma técnica barata, mas muito útil. É também uma técnica mais rápida, cinco vezes mais rápida que a RFLP. O método RAPD envolve:
RFLP
O polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição ou RFLP é uma técnica muito útil para estudar a sequência genômica de DNA. Ele é desenvolvido para mapear os cromossomos de humanos, milho, camundongos, tomate etc. RFLP é um método não baseado em PCR no qual a amostra de DNA é quebrada em fragmentos e então eles são digeridos por enzimas restritivas e resulta em fragmentos de restrição que são separados de acordo com seu comprimento por eletroforese em gel. Em RFLP apenas 1-3 loci são detectados. Essa técnica foi a primeira técnica de perfil de DNA barata o suficiente para ser amplamente aplicada. RFLP é uma ferramenta útil para a detecção de doenças genéticas, risco de doença e testes de paternidade. A análise RFLP também foi útil na identificação de evidências recuperadas da cena do crime porque foi a base para os primeiros métodos de impressão digital. A técnica RFLP é subdividida em duas: paradigmas single- (SLP) e multilocus probe (MLP). O SLP é mais preferido do que o MLP porque é facilmente interpretado, sensível e pode analisar amostras de DNA mistas. No SLP, podemos obter dados mesmo quando o DNA está degradado, como nos restos ósseos.
Principais diferenças
- RAPD é uma técnica útil para construir um mapa de DNA, enquanto a técnica RFLP é útil para estudar a sequência genômica de DNA.
- A análise RAPD é um método baseado em PCR, enquanto a análise RFLP é um método não baseado em PCR.
- Em RAPD é necessária uma pequena quantidade de DNA, enquanto em RFLP é necessária uma grande quantidade de DNA.
- O RAPD pode detectar de 1 a 10 loci, enquanto o RFLP pode detectar de 1 a 3 loci.
- RAPD é cinco vezes mais rápido que RFLP.
- O método RAPD inclui: extração de DNA seguida de amplificação usando primers aleatórios por PCR e eletroforese em gel final do DNA amplificado e visualização de marcadores.
- O método RFLP inclui: A amostra de DNA é quebrada em fragmentos e digerida por enzimas de restrição, resultando em fragmentos de restrição que são separados de acordo com seu comprimento por eletroforese em gel e Southern blotting final por sondas específicas e detecção de sequência específica.